9月4日，国际学术期刊Frontiers in Genetics在线发表了胡晓湘课题组题为“Genetic Dissection of Growth Traits in a Unique Chicken Advanced Intercross Line”的研究论文。该研究利用课题组长期持续构建的鸡深度杂交系（AIL），结合选择信号/关联分析/数据检索的多种方法，鉴定到了多个影响鸡生长性状的主效QTL，并一步法鉴定到影响鸡骨骼发育的PHOSPHP1和IGF2BP1基因，为后续禽类骨骼发育机制研究提供了重要基础。

胡晓湘课题组自从2008年起以岭南黄肉鸡和惠阳胡须鸡为远交双亲构建了全世界少有的鸡深度远源杂交系（AIL），该家系可以通过增加样本间的重组事件来缩小遗传定位的置信区间。本研究发现，此家系传递过程中每个F9样本基因组已经将F0彻底碎片化，伴随了连锁不平衡的快速衰减，最小等位基因频率的有限偏倚，充分保留着杂交群体丰富的核苷酸多样性，说明这是一个进行精细定位的理想资源。F9的关联分析和祖源单倍型关联分析直接锁定27号染色体中部120 Kb的区间包含影响骨骼生长的PHOSPHO1，IGF2BP1等基因，位于上述基因内部的多个突变的功能已经在人类身高突变数据库和基因敲除小鼠中得到确认，这位下游骨骼发育相关基因和通路的功能研究提供了基础。此外，结合选择信号分析还鉴定到GGA4中因单倍型固定导致的GWAS模型失效的QTL。本研究展示了鸡远源深度杂交系在数量性状定位中发挥的显著功效，该群体亲本之一岭南黄鸡携带的丰富多态性使我们有机会充分理解复杂主效QTL内部的遗传模式。

我校生物学院胡晓湘教授，广东农科院动物所罗成龙研究员为文章共同通讯作者，我校博士后王宇哲和博士生卜李娜为论文共同第一作者。我校生物学院赵毅强副教授，广东农科院动物所舒鼎铭研究员，瞿浩研究员参与了工作。上述研究工作得到了国家自然科学基金等项目的资助。

全文链接：https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00894