教师简介

姓名：	史文聿
性别：	男
系别：	植物科学
职称：	副教授
学位：	博士

　　史文聿 博士、副教授，2010年毕业于中央民族大学统计学专业，2017年毕业于中国科学院大学遗传学专业，先后在中国科学院微生物研究所和中国农业大学就职。主要从事微生物与宿主的互作关系解析、大数据挖掘和人工智能算法设计和大数据平台构建工作，擅长用数学工具解决生物学问题。

学习与工作经历

2022.10 至今 中国农业大学 生物学院 （副教授）

2017.09 - 2022.09 中国科学院微生物研究所 微生物资源与大数据中心 （助理研究员）

2011.09 - 2017.07 中国科学院大学 生命学院 中国科学院北京生命科学研究院 生物信息学 （博士）

2006.09 - 2010.07 中央民族大学 理学院 统计学 （学士）

研究方向

生物信息学、计算基因组学、微生物组学

主讲课程

联系方式

电话：

邮件：shiwy [at] cau.edu.cn

通讯地址：北京市圆明园西路2号 中国农业大学生物学院

发表文章

1. Dongmei Liu(#), Yifei Zhang, Guomei Fan, Dingzhong Sun, Xingjiao Zhang, Zhengfei Yu, Jinfeng Wang, Linhuan Wu, Wenyu Shi(*), Juncai Ma(*). IPGA: A handy integrated prokaryotes genome and pan‐genome analysis web service. iMeta, 2022: e55.

2. Wenyu Shi(#), Guomei Fan, Zhihong Shen, Chuan Hu, Juncai Ma, Yuanchun Zhou, Zhen Meng, Songnian Hu, Yuhai Bi, Liang Wang, Haiying Yu, Siru Lin, Xiuqiang Sun, Xinjiao Zhang, Dongmei Liu, Qinlan Sun(*), Linhuan Wu(*). gcCov: Linked open data for global coronavirus studies[J]. Mlife, 2022, 1(1): 92-95.

3. Wenyu Shi(#), Qinlan Sun(#), Guomei Fan, Sugawara Hideaki, Ohkuma Moriya, Takashi Itoh, Yuguang Zhou, Man Cai, Song-Gun Kim, Jung-Sook Lee, Ivo Sedlacek,David R. Arahal, Teresa Lucena, Hiroko Kawasaki, Lyudmila Evtushenko, Bevan S. Weir, Sarah Alexander, Dlauchy Dénes, Somboon Tanasupawat, Lily Eurwilaichitr, Supawadee Ingsriswang, Bruno Gomez-Gil, Manzour H. Hazbón, Marco A. Riojas, Chatrudee Suwannachart, Su Yao, Peter Vandamme, Fang Peng, Zenghui Chen, Dongmei Liu, Xiuqiang Sun, Xinjiao Zhang, Yuanchun Zhou, Zhen Meng, Linhuan Wu(*), Juncai Ma(*). gcType: A High-quality 10K type strain genome database for microbial phylogenetic and functional research, Nucleic Acids Research, 2021, 49(D1): D694-D705.

4. Wenyu Shi(#), Heyuan Qi(#), Qinglan Sun, Guomei Fan, Shuangjiang Liu, Jun Wang, Baoli Zhu, Hongwei Liu, Fangqing Zhao, Xiaochen Wang, Xiaoxuan Hu, Wei Li, Jia Liu, Ye Tian, Linhuan Wu(*), Juncai Ma(*). gcMeta: a Global Catalogue of Metagenomics platform to support the archiving, standardization and analysis of microbiome data, Nucleic Acids Research, 2019, 47(D1): D637-D648.

5. Jinfeng Wang(#), Jiayong Zheng(#), Wenyu Shi(#), Nan Du, Xiaomin Xu, Yanming Zhang, Peifeng Ji, Fengyi Zhang, Zhen Jia, Yeping Wang, Zhi Zheng, Hongping Zhang, Fangqing Zhao(*). Dysbiosis of maternal and neonatal microbiota associated with gestational diabetes mellitus. Gut, 2018, 67(9): 1614-1625.

6. Wenyu Shi(#), Peifeng Ji(#), Fangqing Zhao(*). The combination of direct and paired link graphs can boost repetitive genome assembly, Nucleic Acids Research, 2017, 45(6): e43-e43.

承担项目及课题

1. 自然基金青年项目，宏基因组功能基因的靶向挖掘算法研究，2019.01 – 2021.12，23 万元，课题负责人，完成

2. 自然基金面上项目，基于宏基因组数据的微生物表型与生长条件精准预测算法研究，2022.01 – 2025.12， 58 万元，课题负责人，在研

专利情况

社会兼职