1. SDS-PAGE 条带（考染或银染），需有肉眼可见的清晰条带；制胶过程中要严格控制角蛋白污染。

2. 蛋白溶液，需明确标注蛋白的浓度和使用缓冲液的组分和浓度，不得含有 SDS、NP-40、RIPA、CHAPS 和 Triton 等表面活性剂，若蛋白溶液含有表面活性剂，请提前联系生物质谱室工作人员，获取 FASP 酶解膜（10 kDa cut off 超滤膜）进行清洗和溶剂置换，彻底去除表面活性剂后，方可送样分析。

3. 抗体磁珠（Magnetic Beads），beads 悬浮液不得含有 SDS、Triton、NP-40 等表面活性剂。

4. 大规模定量蛋白质组学实验：植物材料需要 1 g 及以上；细胞需要1×106个细胞；动物组织需要 10 mg 以上。

5. 蛋白翻译后修饰位点鉴定通常需要对修饰后的蛋白或者肽段进行富集，需要使用富集（抗体）小柱，送样前请联系生物质谱实验室确认。

6. 如需使用胰蛋白酶之外的特殊蛋白酶，送样前请联系生物质谱实验室确认。